Учёные из России и других стран разработали единую платформу Shambhala, которая позволяет объединять большие данные (big data) по уровню активности множества генов. Эта база данных предоставляет учёным возможность сопоставлять информацию из различных генетических экспериментов, ранее считавшихся несовместимыми. Платформа создана, чтобы помочь исследованиям в области геномики и биологии.
Shambhala преобразует данные о генной экспрессии в унифицированный формат, что позволяет объединить их в единую матрицу и проводить сравнительные анализы. До этого результаты генетических исследований получали с использованием разных методик, и их было трудно согласовать между собой. Создатели Shambhala применили алгоритм CuBlock, который учитывает особенности работы изучаемых генов и позволяет гармонизировать разнородные данные.
Платформа была протестирована на множестве данных о генной активности в опухолевых и здоровых тканях человека. Результаты исследования показали, что Shambhala превосходит другие методики гармонизации данных по многим параметрам. Это открывает перспективы для более точного анализа генной экспрессии, что, в свою очередь, может помочь в разработке эффективных лечебных методов для хронических заболеваний, включая онкологию и инфекции. Эти данные также могут содействовать разработке новых поколений вакцин и лекарств.
Фото: freepik
ГОР